Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rasgef1bQ8JZL7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rasgef1bQ8JZL7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rasgef1bQ8JZL7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Rasgef1bQ8JZL7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rasgef1bQ8JZL7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rasgef1bQ8JZL7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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