Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trip10Q8CJ53 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms