Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rdh13Q8CEE7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms