Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc17Q8CE13 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc17Q8CE13 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms