Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fbxo43Q8CDI2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms