Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vcpip1Q8CDG3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms