Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9L1

BC106179, BC106179 protein, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC106179Q8C9L1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC106179Q8C9L1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC106179Q8C9L1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC106179Q8C9L1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC106179Q8C9L1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC106179Q8C9L1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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