Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ppfibp1Q8C8U0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ppfibp1Q8C8U0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms