Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc113Q8C5T8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccdc113Q8C5T8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccdc113Q8C5T8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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