Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q8C5C9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q8C5C9 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms