Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ctdsp2Q8BX07 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms