Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nup54Q8BTS4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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