Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sfr1Q8BP27 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sfr1Q8BP27 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms