Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga3Q8BMI3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga3Q8BMI3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms