Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tspan12Q8BKT6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tspan12Q8BKT6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms