Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp1Q8BJQ2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp1Q8BJQ2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms