Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy1Q8BIJ7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms