Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4bQ8BGE6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4bQ8BGE6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4bQ8BGE6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Atg4bQ8BGE6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg4bQ8BGE6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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