Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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