Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc172Q810N9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc172Q810N9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms