Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NischQ80TM9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms