Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ube2q1Q7TSS2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ube2q1Q7TSS2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2q1Q7TSS2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms