Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Clec18aQ7TSQ1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms