Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vtcn1Q7TSP5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vtcn1Q7TSP5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms