Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ScocQ78YZ6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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ScocQ78YZ6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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