Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vma21Q78T54 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vma21Q78T54 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Vma21Q78T54 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vma21Q78T54 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vma21Q78T54 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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