Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sys1Q78S06 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms