Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms