Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SpopQ6ZWS8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SpopQ6ZWS8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms