Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc88cQ6VGS5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms