Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
GcsamQ6RFH4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms