Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zbtb40Q6PCS8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms