Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hdac10Q6P3E7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms