Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp140Q6NSQ5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sp140Q6NSQ5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sp140Q6NSQ5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp140Q6NSQ5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Sp140Q6NSQ5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sp140Q6NSQ5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp140Q6NSQ5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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