Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Atp11bQ6DFW5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atp11bQ6DFW5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atp11bQ6DFW5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Atp11bQ6DFW5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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