Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Top2bQ64511 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms