Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc18Q640L5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc18Q640L5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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