Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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Ss18Q62280 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ss18Q62280 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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