Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms