Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sema3cQ62181 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sema3cQ62181 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms