Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sin3bQ62141 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms