Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itga6Q61739 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms