Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln3Q61124 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms