Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gbp4Q61107 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gbp4Q61107 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms