Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SkiQ60698 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms