Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd4Q60688 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd4Q60688 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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