Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prdm1Q60636 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prdm1Q60636 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms