Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsr1Q5SWD9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms