Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Vmn1r196Q5SVD5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r196Q5SVD5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms