Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d1Q5SSN7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d1Q5SSN7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms